Биологија, рачунарство и инжењерство се спајају у Шелемателију

Одсек за биосистеме Политехничког универзитета у Цириху спреман је у Базелу у иновативној згради БСС локалног Кампуса природних наука

Инжењерска компјутерска биологија: од математичке теорије до ћелија људског тела, у истраживању унутар зграде БСС Федералног института за технологију у Цириху у Базелу
Нова зграда Федералног института за технологију у Цириху у оквиру кампуса животних наука у Сцхаллематтели: иновативно седиште Д-БССЕ (Одељења за науку о биосистемима и инжењеринг), у облику петоугла, налази се у близини Биоцентрума, Пхармазентрум, у ДБМ-у, као иу Дечјој болници и Универзитетској болници у Базелу (Фото: Ерицх Меиер)

У Швајцарској, идеја да ЕТХ Цирих оснује Одељење за биосистеме у Базелу дуго се чинила неостваривом.

Данас налази своје место у новој згради где су границе између биологије, рачунарства и инжењерства замагљене и истраживачи се све више фокусирају на медицинске примене.

Прве посетиоце нове зграде БСС очекује импресиван поглед.

Одмах након рецепције, уроњени сте у изненађујуће светао и прозрачан простор, импресиван атријум преплављен светлошћу и на врху прозирног стакленог крова.

На крају овог огромног улаза, спирално степениште вијуга до горњих спратова.

Утисак је бесконачног броја повезујућих линија, али ово је апсолутно намерно: то је стратегија коју су архитекте смислиле да би подстакле комуникацију и интеракцију између истраживачких група.

У овом тренутку, предворје је препуно студената који путују ранцем, од којих се неки крећу кривудавом стазом до удобног бистроа.

Истраживачи који чекају лифт заустављају се на кратко разговор пре него што оду до својих радних станица.

Једна локација и БИОС+ бренд за институте ИРБ, ИОР и ЕОЦ

Инжењерска компјутерска биологија: од математичке теорије до ћелија људског тела, у истраживању унутар зграде БСС Савезне политехнике у Цириху у Базелу са Ренатом Паром
Ренато Паро је професор емеритус на Одсеку за науку о биосистемима и инжењеринг на Федералном институту за технологију у Цириху у Базелу
(Фото: ЕТХ Цирих)

Ренато Паро: „Ова зграда представља кулминацију изузетног путовања“

У центру атријума се налазе Ренато Паро e Свен Панке.

Бивши, сада професор емеритус молекуларне биологије, и даље је видно импресиониран архитектонским концептом.

„Када уђем у зграду БСС и видим све ове канцеларије, лабораторије и заједничке истраживачке платформе, чини ми се да је сво време и труд који смо уложили у стварање нашег одељења заиста вредело“Он каже.

Именован за првог директора новонасталог Центра за науку и инжењерство о биосистемима (Ц-БССЕ) 2006. године, Ренато Паро је касније постао једна од покретачких снага у стварању Одељења за науку и инжењерство биосистема (Д-БССЕ) на ЕТХ.

“За мене ово имање представља кулминацију изузетног путовања”, он тврди.

Фотогалерија, инаугурација Истраживачког центра "Белли".

Инжењерска компјутерска биологија: од математичке теорије до ћелија људског тела, у истраживању унутар зграде БСС Федералног института за технологију у Цириху у Базелу са Свеном Панкеом
Свен Панке је шеф Одсека за науку о биосистемима и инжењерство на Федералном институту за технологију у Цириху у Базелу
(Фото: ЕТХ Цирих)

Свен Панке: „На сваком спрату мешавина истраживачких група, а не тематских области“

„Од фазе пројектовања, наш циљ је био да направимо зграду у којој су све различите компоненте подстицале интеракцију и научну размену“, наставља Панке.

Ове године ће преузети узде катедре и често климати главом када говори, истичући и како су сви присутни професори стално доприносили да се изгради нешто лепо на основу оригиналног концепта: "Одлучили смо да сваки спрат треба да има мешавину истраживачких група, а не организован по предметним областима."

Видео, "лак" централе института ЕОЦ, ИОР и ИРБ

Инжењерска компјутерска биологија: од математичке теорије до ћелија људског тела, у истраживању унутар зграде БСС Федералног института за технологију у Цириху у Базелу
Засвођена стаклена и челична купола уносе пуно природног светла у велико унутрашње двориште зграде БСС у кампусу Сцхаллематтели Лифе Сциенцес у близини Базела
(Фото: Алессандро Делла Белла/ЕТХ Цирих)

Експериментална биологија, теоријско рачунарство и биоинжењеринг у блиском контакту

Одељење је подељено у три главне области (експериментална биологија, теоријска рачунарска биологија и биоинжењеринг), а на сваком спрату зграде смештена је мешавина експерименталних биолога, биоинформатичара и биоинжењера, који раде у суседним канцеларијама и лабораторијама.

„Брзо смо схватили да је једна од главних предности Д-БССЕ-а да све три ове истраживачке области доведемо под један кишобран како бисмо подстакли групе да међусобно комуницирају. А сада када смо сви под истим кровом, још је лакше мешати се и комуницирати.", каже Панке.

„Ово је интердисциплинарност на делу и привлачи истраживаче из целог света".

У Белинзони, супер стуб изврсности у наукама о животу

Инжењерска компјутерска биологија: од математичке теорије до ћелија људског тела, у истраживању у згради БСС Федералног института за технологију у Цириху у Базелу са Ником Беренвинкелом
Нико Бееренвинкел је редовни професор рачунарске биологије на Одсеку за науку о биосистемима и инжењерство на ЕТХ Цириху у Базелу
(Фото: ЕТХ Цирих)

Истраживачи из 42 земље, случајеви Ника Беренвинкел и Тање Штадлер

Д-БССЕ тренутно запошљава научнике из 42 различите земље.

Лабораторија за биопроцес Свена Панкеа, на пример, на истом је нивоу као и група коју води Нико Беренвинкел.

Обојица су снажни присталице специјалне мисије одељења, која настоји да комбинује основна истраживања у наукама о животу са приступом математике и рачунарства, а истовремено укључује технолошку и инжењерску компоненту.

Панке је специјализован за технике минијатуризације за биопроцесни инжењеринг, које се могу користити за откривање и синтетичку контролу побољшаних варијанти ћелија.

Бееренвинкел, с друге стране, комбинује математику, рачунарство и вештачку интелигенцију са биологијом и медицином.

Примене његових рачунарских метода укључују способност карактеризације и описа вирусних болести на молекуларном нивоу.

Његови модели су се показали као веома корисно средство током пандемије коронавируса.

Заједно са Тањом Штадлер, професорком рачунарске еволуције на Д-БССЕ и председавајућим Швајцарске научне саветодавне групе за ЦОВИД-19, играо је важну улогу у напорима да се идентификују нове варијанте вируса и да се прати њихова еволуција и ширење.

У Лугану иновативна раскрсница између људских и природних наука

Инжењерска компјутерска биологија: од математичке теорије до ћелија људског тела, у истраживању унутар зграде БСС Федералног института за технологију у Цириху у Базелу са Тањом Штадлер
Тања Штадлер је заменик шефа Одсека за науку и инжењерство биосистема на Федералном институту за технологију Цирих у Базелу
(Фото: ЕТХ Цирих)

Ћелије, органоиди и микроорганизми са својствима која се не налазе у природи

Рад истраживача Д-БССЕ заснива се на основама системске биологије.

Његов циљ је да генерише холистичко разумевање функционисања ћелија, органа и организама и временских и биохемијских процеса који их одржавају у животу.

Да би га проучавали, истраживачи обично користе велике скупове података, генерисане технологијама велике пропусности као што су ДНК секвенцери, као и математички модели и компјутерске симулације.

Системска биологија такође игра важну улогу у другој истраживачкој линији Д-БССЕ.

Ово је синтетичка биологија, чији је главни циљ да произведе ћелије, органоиде и микроорганизме са новим својствима која се не налазе у природи, од којих многе нуде потенцијалне медицинске користи.

Највиши небодер у Швајцарској је храм иновација

Инжењерска компјутерска биологија: од математичке теорије до ћелија људског тела, у истраживању унутар зграде БСС Федералног института за технологију у Цириху у Базелу
Нова зграда Федералног института за технологију у Цириху у оквиру кампуса животних наука у Сцхаллематтели: иновативно седиште Д-БССЕ (Одељења за науку о биосистемима и инжењеринг), у облику петоугла, налази се у близини Биоцентрума, Пхармазентрум, у ДБМ-у, као и у Дечјој болници и Универзитетској болници у Базелу
(Фото: Ерих Мајер)

Водећи: вакцине и антитела за синтетичку имунологију и технологије лабораторије на чипу

Рад Д-БССЕ у биоинжењерингу, који користи ДНК за регулисање ћелија и организама, има подједнако практичан циљ.

Конкретни резултати овог истраживања укључују вакцине и антитела за синтетичку имунологију, као и ћелијске импланте који могу да помогну у борби против метаболичких поремећаја, као и минијатуризоване платформе као што су лаб-он-цхип технологије.

„Две пионирске области рада нашег одељења у Базелу су биоинжењеринг и рачунарска наука о подацима“, каже Панке, који је од 2009. године део Департмана за биосистемске науке и инжењерство.

„Има смисла да нашим студентима покажемо и предности комбиновања ове две компоненте.

Видео, футуристички торањ 2 седишта Роцхеа у Базелу

Инжењерска компјутерска биологија: од математичке теорије до ћелија људског тела, у истраживању унутар зграде БСС Федералног института за технологију у Цириху у Базелу
Синтетичка биологија је кључна истраживачка област новог одељења за интегрисане студије Федералног института за технологију у Цириху у Шелемателију близу Базела
(Фото: Алессандро Делла Белла/ЕТХ Цирих)

ЕТХ идеја је проклијала 2000. године упркос скептицизму циришке штампе

Идеја о стварању истраживачког института за бионауку у ЕТХ Базелу почела је да клија 2000. године.

Гледајући уназад, јасно је колико је ова визија била смела.

Једнако проницљива је била и одлука ЕТХ Цириха да трансформише Д-БССЕ у посебно одељење у Базелу 2007. године и да му обезбеди сигурно дугорочно финансирање.

Наравно, еволуција Одељења за науку и инжењерство биосистема није увек била ружичњак: 2003. године, на пример, Неуе Зурцхер Зеитунг је у неким чланцима известио да је пројекат стварања испоставе ЕТХ у граду Рајнланду наишао на потешкоће. .

Лист је изразио чуђење због планова ЕТХ Цириха да створи потпуно одељење за биоинжењеринг или биомедицинско инжењерство у Базелу: „Таква велика идеја изгледа скоро неостварива.

Али скептицизам новинара се показао неоснованим.

Иновације и науке о животу? Будућност… „мало благо“ Аргауа

Инжењерска компјутерска биологија: од математичке теорије до ћелија људског тела, у истраживању унутар зграде БСС Федералног института за технологију у Цириху у Базелу
Нова зграда Федералног института за технологију у Цириху у оквиру кампуса животних наука у Сцхаллематтели: иновативно седиште Д-БССЕ (Одељења за науку о биосистемима и инжењеринг), у облику петоугла, налази се у близини Биоцентрума, Пхармазентрум, у ДБМ-у, као и у Дечјој болници и Универзитетској болници у Базелу
(Фото: Ерих Мајер)

Од локације Росентал до зграде БСС садашњег кампуса природних наука

Следећа фаза развоја Д-БССЕ догодила се преласком са локације Росентал у зграду БСС у кампусу за науке о животу Сцхаллематтели.

Како системска биологија и синтетичка биологија добијају на снази и знање у овим областима наставља да напредује, све је већи нагласак на превођењу основних налаза истраживања у медицинске примене.

„Данас, системска биологија често има тако дубоко разумевање како ћелија функционише да може да пружи већину информација за контролу кључних процеса унутар ћелије., објашњава Паро.

„Користећи ову стручност, синтетички биолози могу репрограмирати ћелију да изврши нови задатак. У будућности би се ове репрограмиране ћелије могле користити у терапеутске сврхе."

4,2 милијарде франака више од развојног центра Сисслерфелд

Инжењерска компјутерска биологија: од математичке теорије до ћелија људског тела, у истраживању унутар зграде БСС Федералног института за технологију у Цириху у Базелу
Инфографика о настанку и изградњи зграде БСС у Базелу од тренутка зачећа 2003. до стварне инаугурације 2024.
(Илустрација: ЕТХ Цирих)

Успех транслационог истраживања у оквирима добре производне праксе

Али такве ћелије се могу користити код пацијената само ако су произведене у складу са најстрожим фармаколошким стандардима.

Пре пресељења, Д-БССЕ није имао потребну инфраструктуру за ову намену, али је нова зграда БСС опремљена објектом ГМП, односно добре производне праксе.

„То значи да сада можемо да пређемо на транслациону фазу нашег истраживања“, каже Паро.

„Радећи под ГМП условима, можемо побољшати репрограмиране ћелије и прочистити их тако да се могу користити у клиничким испитивањима.

Колико вреди сектор науке о животу у Швајцарској која говори италијански?

Инжењерска компјутерска биологија: од математичке теорије до ћелија људског тела, у истраживању унутар зграде БСС Федералног института за технологију у Цириху у Базелу
Нова зграда Федералног института за технологију у Цириху у оквиру кампуса животних наука у Сцхаллематтели: иновативно седиште Д-БССЕ (Одељења за науку о биосистемима и инжењеринг), у облику петоугла, налази се у близини Биоцентрума, Пхармазентрум, у ДБМ-у, као и у Дечјој болници и Универзитетској болници у Базелу
(Фото: Ерих Мајер)

Лечење уз помоћ Универзитетске и Универзитетске болнице у Базелу

Новом ГМП или структуром добре производне праксе управља ЕТХ Цирих у сарадњи са Универзитетом у Базелу и Универзитетском болницом у Базелу.

Истраживачима пружа ригорозно контролисано окружење за производњу производа за терапију гена, ћелија и ткива који испуњавају регулаторне захтеве за клиничка испитивања на људима.

Ова еволуција ка транслационом истраживању такође је олакшана новом локацијом Д-БССЕ-а на кампусу природних наука у Шелемателију, који се налази у непосредној близини Универзитетске болнице у Базелу, Универзитетске дечије болнице у Базелу и Биоцентрума Универзитета у Базел.

Одељење за биомедицину Универзитета у Базелу и Истраживачки центар за здравље деце у граду Рајнланд такође планирају да изграде нове просторије у близини.

Ова близина би требало додатно да убрза превођење биолошких истраживања у медицинске примене.

Кључна иновација биомедицинског округа Мирандола

Зграда БСС Кампуса природних наука Федералног института за технологију Цирих у Базелу

Све о Одсеку за науку о биосистемима и инжењерство на ЕТХ Цириху у Базелу

Инжењерска компјутерска биологија: од математичке теорије до ћелија људског тела, у истраживању унутар зграде БСС Федералног института за технологију у Цириху у Базелу
Засвођена стаклена и челична купола уносе пуно природног светла у велико унутрашње двориште зграде БСС у кампусу за науке о животу Сцхаллематтели у близини Базела (Фото: Алессандро Делла Белла/ЕТХ Цирих)